间歇跑之所以比持续跑更“累”，关键在于它对心血管系统和肌肉代谢的反复高强度刺激。持续跑多处于相对稳定的有氧状态，心率、血压和通气量上升到一定水平后趋于平稳；而间歇跑由高强度冲刺和短暂恢复交替组成，每次冲刺都会让心率迅速攀升，交感神经反复激活，儿茶酚胺分泌增加，心脏需要在短时间内提高泵血能力，收缩压和每搏输出量也会随之波动。
高强度阶段中，肌肉对氧的需求迅速增加，机体来不及完全依靠有氧代谢供能，无氧供能比例上升，乳酸、氢离子等代谢产物堆积，肌肉酸胀和呼吸急促感更明显。短暂恢复期又不足以让心率、乳酸和通气完全回到基线，下一次冲刺便叠加在前一次疲劳之上，形成“未完全恢复又再次负荷”的状态。
此外，间歇跑时呼吸频率和通气量反复大幅变化，呼吸肌做功增加，主观用力感更强；肌肉传入神经信号、体温升高和血流重新分配也会加重疲劳体验。持续跑虽然时间长，但强度相对平稳，乳酸产生与清除更易达到平衡，因此主观上往往不如间歇跑那样“顶”。
需要提醒的是，间歇跑强度较高，并非人人适合。平时缺乏运动、血压控制不佳或存在冠心病等心血管疾病的人群，运动前应咨询医生，制定个体化运动方案；正在用药者需在医生指导下应用，不宜自行调整。
