扁桃体发炎的治疗需根据病因、病情严重程度及个体差异综合判断，通常需结合抗生素、抗病毒药物、解热镇痛药、中成药及局部治疗等方案，但不存在“效果最好”的单一药物，需在医生指导下选择最适合的方案。
细菌感染是扁桃体炎的常见病因，尤其是链球菌感染。若血常规、C反应蛋白等检查提示细菌感染，或存在脓性分泌物、高热不退等症状，医生可能建议使用抗生素，如青霉素类、头孢菌素类或大环内酯类，以抑制细菌繁殖、控制炎症。
病毒感染（如腺病毒、流感病毒）也可引发扁桃体炎，表现为咽痛、低热、乏力等。此时抗生素无效，需使用抗病毒药物，如奥司他韦（针对流感病毒）或利巴韦林（需严格掌握适应症），同时配合对症支持治疗。
无论细菌或病毒感染，发热、咽痛剧烈时，可短期使用解热镇痛药（如对乙酰氨基酚、布洛芬）缓解症状，但需避免长期或过量使用。
部分中成药（如蒲地蓝消炎口服液、蓝芩口服液）具有清热解毒、利咽消肿的功效，可作为辅助治疗，但需注意辨证使用。
局部治疗可缓解咽部不适，如含漱淡盐水、使用含片（如西地碘含片）或喷雾剂（如开喉剑喷雾剂），但需避免刺激性物质损伤黏膜。
扁桃体炎的治疗需严格遵循医嘱，切勿自行用药或增减剂量。若出现高热不退、吞咽困难、呼吸困难或扁桃体周围脓肿等严重症状，应立即就医，必要时需手术干预。
