细菌脚臭和真菌脚臭可以通过观察患者是否有足癣、皮肤念珠菌感染、甲状腺肿大等病症进行区分。
1、足癣：细菌脚臭一般是生理性因素引起的，如果脚部运动量过大，脚部出汗增多，就会为细菌的生长与繁殖提供有利条件，经细菌对角蛋白的分解，从而引起脚臭的症状，真菌脚臭通常是因为感染红色毛癣菌、须癣毛癣菌等病原菌引起的。如果只是单纯的脚臭，脚部皮肤完好，一般为细菌脚臭。如果脚部皮肤出现脱皮、水疱、瘙痒等症状，一般为真菌脚臭。
2、皮肤念珠菌感染：细菌脚臭的患者，身体素质一般良好，没有其他皮肤疾病。真菌脚臭的患者通常伴随皮肤念珠菌感染等各种皮肤病。如果患者在脚臭的同时还伴随其他皮肤症状一般为真菌脚臭。
3、甲状腺肿大：细菌脚臭是生理性原因引起的，患者一般比较健康，不会出现甲状腺肿大的情况。真菌脚臭的部分患者通常因为患有甲状腺功能亢进症导致基础代谢加快，出汗增多，引起脚臭。如果患者本身甲状腺肿大，就出现脚臭的症状，一般考虑是真菌脚臭。
如果是因为足癣、糖尿病、甲状腺功能亢进症等原因引起的脚臭，应积极针对原发病进行治疗。日常生活中应保持足部的清洁，避免进食容易出汗的食品，比如辣椒、生蒜、葱、姜等，可以减轻症状。
