肠胃炎的药物治疗需根据病因、症状及个体情况综合选择，常见药物包括抗生素、止泻药、解痉药、益生菌及黏膜保护剂等，但具体用药需结合临床评估，避免自行滥用。
若为细菌感染引发的肠胃炎，如沙门氏菌、志贺氏菌感染，医生可能根据药敏试验结果选用抗生素，以抑制或杀灭病原菌，缩短病程。但病毒感染（如诺如病毒、轮状病毒）或非感染性因素（如食物过敏、药物刺激）引起的肠胃炎，抗生素无效且可能加重肠道菌群紊乱，需严格区分病因后使用。
腹泻是肠胃炎常见症状，轻中度腹泻可通过口服补液盐预防脱水，若腹泻频繁、量大，医生可能短期使用止泻药（如蒙脱石散）吸附肠道毒素、保护黏膜，或洛哌丁胺减少肠蠕动。但严重感染性腹泻早期禁用强效止泻药，以免毒素滞留加重病情。
腹痛明显时，解痉药（如匹维溴铵、山莨菪碱）可通过松弛肠道平滑肌缓解痉挛性疼痛。
益生菌（如双歧杆菌、乳酸杆菌）可调节肠道菌群平衡，辅助恢复消化功能，尤其适用于抗生素相关腹泻或菌群失调患者，但需与抗生素间隔2小时服用以避免失效。
黏膜保护剂（如铝碳酸镁、硫糖铝）能覆盖肠道黏膜表面，形成保护层，减少胃酸及毒素刺激，促进黏膜修复，常用于合并胃黏膜损伤的肠胃炎患者。
肠胃炎用药需严格遵循医嘱，根据病因、症状轻重及个体差异调整方案。若出现高热、血便、意识模糊、脱水征（如少尿、皮肤干燥）或症状持续48小时未缓解，应立即就医，通过血常规、粪便培养等检查明确病因，避免延误治疗。
