七岁的男孩阴茎短小可能是正常的生理现象，但也不能排除是病理因素导致，如肥胖症、生长激素缺乏症等。如果为生理现象，通常无需特殊治疗，但如果为病理因素导致，则可通过口服药物、局部用药、生活调整等治疗。
一、生理现象：
正常情况下，男孩在10到13岁左右时才会进入第二性征的发育阶段，而在7岁时还未达到生长发育阶段，所以会出现阴茎短小的情况。这属于正常的生理现象，只要男孩没有出现异常的不适症状，无需过于担心，平时在生长发育期对局部观察即可。
二、病理因素：
1、肥胖症：如果男孩平时经常摄入高脂肪食物，如油炸食品、肥肉等，会导致生殖器部位皮下的脂肪含量较高，从而使阴茎隐匿于脂肪中，使局部看起来比较短小。平时应让男孩避免吃高脂肪食物，可以低脂肪、低热量的食物为主，如燕麦、荞麦、胡萝卜、橙子等，并增强体育锻炼，如跳绳、跑步等，可有效的促进身体脂肪燃烧，改善症状。
2、生长激素缺乏症：如果男孩垂体前叶分泌的生长激素不足，会影响到身体的正常发育，导致阴茎短小情况，同时并伴有身高矮小、智力异常等。可前往医院在专业医师指导下局部注射用重组人生长激素、重组人生长激素注射液、盐酸精氨酸注射液等药物治疗，可有效的缓解症状。
除上述常见原因外，还有可能是由于阴茎海绵体挫伤等原因导致，应完善检查，配合医生给予正确的治疗。
