比较常见的危害就是术中术后大出血，也有可能会引起术后嗅觉减退，鼻腔干燥，鼻腔异物感，还有可能会引起反复的鼻塞，有一小部分患者会出现视力下降，视野缺损，还有可能会引起脑脊液鼻漏，颅内感染。但是总体来说，鼻窦炎手术属于常规手术。
目前手术技术是比较成熟的，大部分患者在做完手术以后，都是可以顺利康复的，只有一少部分患者会出现手术的并发症。在手术以后需要定期复诊，观察手术效果，明确恢复情况。
鼻窦炎手术虽然属于常规治疗手段，但依然存在一定的风险与潜在并发症。较为常见的是术中或术后出血，部分患者术后可能出现嗅觉减退、鼻腔干燥或异物感，也有患者会经历反复鼻塞。少数情况下，手术还可能影响到眼部区域，导致视力下降或视野缺损，极个别患者甚至会出现脑脊液鼻漏或颅内感染等严重并发症。
不过，随着手术技术和设备的不断成熟，大多数患者术后均能顺利恢复，真正出现严重并发症的比例并不高。术后需要按照医嘱定期复查，以便医生评估手术效果并掌握恢复进程。对于术后仍伴随轻微鼻塞或鼻腔不适的人群，日常护理中可以考虑使用小海鲸硅胶洗鼻器，配合专用洗鼻剂与接近体温的纯净水调配成等渗盐水，轻柔冲洗鼻腔，有助于保持鼻腔清洁与通畅。使用时轻压瓶身控制水流即可，适用于五岁及以上人群。若处于鼻炎发作期或鼻部症状较明显，可适当增加护理频率，但具体方案仍建议在医生指导下进行。
